Mettez-vous à la place du recruteur. Que feriez vous à sa place si vous receviez une lettre de motivation "bateau", à peine personnalisée de manière à répondre à l'offre d'emploi. Cela donne déjà une bonne idée de la motivation du candidat pour intégrer l'entreprise et y travailer, non ?
Lorsque vous répondez à une offre de stage ou d"emploi, faites l'effort de rédiger une lettre qui corresponde aux besoins exprimés dans l'offre. Renseignez vous au préalable sur l'entreprise, prouvez dans votre lettre que vous vous y êtes vraiment interessé.
Mettez-vous en valeur, vendez-vous: Mettez en valeur vos points forts qui correspondent aux besoins exprimés dans l'offre.
Une lettre de motivation par mail doit reprendre les mêmes points-clés qu'une lettre traditionnelle.
Comme pour un mailing, rappelez vous du modèle AIDA : Accroche, Intêret, désir, Action : votre lettre doit être construite de la sorte.

Second point: Soyez concis, sauf si vous êtes le PDG d'une multinationale avec plus de 20 ans d'expérience, votre lettre ne devrait, en principe, pas dépassez une page.
Un recruteur voit passer sous ses yeux plusieurs dizaines de CV et de lettres de motivation par jour et il ne consacre en moyenne que 2 à 3 min à la lecture d'une lettre.
Pourtant, celle-ci doit être assez efficace pour le convaincre et lui donner envie de vous rencontrer : en un mot, soyez attractif et percutant.

La forme : comme pour un e-CV celle-ci ne change pas vraiment par rapport à une letre classique : La meilleure des mise en page reste classique, n'abusez pas des fioritures et autres ornements inutiles. Le ton doit rester également celui d'une letre traditionel, restez poli, courtoi et concis : pas de grandes phrases inutiles.
Faîtes attentions aux fautes d'orthographe et de grammaire. Le corecteur automatique de Word reste un bien faible paliatif à cet ecueil donc, relisez-vous et faîtes-vous relire !.
Attention aussi au format de l'envoi : restez classique et ne succombez pas encore aux dernières versions des logiciels. Privilègiez les envois au format Word 95 et 97 ou mieux encore en PDF.